Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CARMIL1Q5VZK9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
CARMIL1Q5VZK9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CARMIL1Q5VZK9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms