Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC6Q5RKV6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC6Q5RKV6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC6Q5RKV6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC6Q5RKV6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC6Q5RKV6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC6Q5RKV6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC6Q5RKV6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC6Q5RKV6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC6Q5RKV6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC6Q5RKV6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC6Q5RKV6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms