Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mcrip1Q3UGS4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mcrip1Q3UGS4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mcrip1Q3UGS4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms