Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA6Q16445 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA6Q16445 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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