Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNPS1Q15287 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNPS1Q15287 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms