Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TROQ12816 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TROQ12816 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TROQ12816 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TROQ12816 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TROQ12816 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TROQ12816 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TROQ12816 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TROQ12816 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TROQ12816 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TROQ12816 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TROQ12816 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TROQ12816 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TROQ12816 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TROQ12816 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TROQ12816 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TROQ12816 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TROQ12816 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TROQ12816 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TROQ12816 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TROQ12816 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TROQ12816 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TROQ12816 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TROQ12816 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TROQ12816 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TROQ12816 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TROQ12816 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TROQ12816 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TROQ12816 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TROQ12816 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TROQ12816 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TROQ12816 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TROQ12816 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TROQ12816 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TROQ12816 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TROQ12816 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TROQ12816 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TROQ12816 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TROQ12816 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TROQ12816 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TROQ12816 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TROQ12816 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
TROQ12816 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TROQ12816 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TROQ12816 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TROQ12816 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TROQ12816 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TROQ12816 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TROQ12816 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TROQ12816 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TROQ12816 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TROQ12816 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TROQ12816 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TROQ12816 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TROQ12816 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TROQ12816 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TROQ12816 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TROQ12816 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TROQ12816 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TROQ12816 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TROQ12816 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TROQ12816 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TROQ12816 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TROQ12816 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TROQ12816 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TROQ12816 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TROQ12816 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TROQ12816 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TROQ12816 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TROQ12816 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TROQ12816 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TROQ12816 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
TROQ12816 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
TROQ12816 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
TROQ12816 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TROQ12816 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TROQ12816 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TROQ12816 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TROQ12816 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
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