Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
LMOD3Q0VAK6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD3Q0VAK6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMOD3Q0VAK6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms