Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4F3Q08477 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F3Q08477 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms