Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnb1Q03717 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnb1Q03717 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms