Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas1P97459 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas1P97459 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Npas1P97459 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Npas1P97459 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas1P97459 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Npas1P97459 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms