Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl23aP62751 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms