Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPD1P62314 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPD1P62314 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.4 ms