Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFC1P60507 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVFC1P60507 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms