Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf5P56477 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf5P56477 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf5P56477 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf5P56477 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf5P56477 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf5P56477 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf5P56477 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irf5P56477 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf5P56477 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf5P56477 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms