Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dsc2P55292 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsc2P55292 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms