Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH15P55291 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH15P55291 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH15P55291 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH15P55291 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH15P55291 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH15P55291 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH15P55291 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH15P55291 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH15P55291 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH15P55291 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH15P55291 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH15P55291 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH15P55291 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH15P55291 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH15P55291 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH15P55291 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH15P55291 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH15P55291 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH15P55291 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH15P55291 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH15P55291 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH15P55291 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH15P55291 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH15P55291 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH15P55291 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH15P55291 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH15P55291 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH15P55291 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH15P55291 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH15P55291 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH15P55291 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH15P55291 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH15P55291 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH15P55291 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH15P55291 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH15P55291 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH15P55291 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH15P55291 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH15P55291 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH15P55291 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH15P55291 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH15P55291 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH15P55291 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH15P55291 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms