Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPFP49454 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPFP49454 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPFP49454 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPFP49454 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPFP49454 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPFP49454 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPFP49454 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPFP49454 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPFP49454 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPFP49454 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPFP49454 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPFP49454 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPFP49454 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPFP49454 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPFP49454 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPFP49454 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPFP49454 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPFP49454 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPFP49454 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPFP49454 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPFP49454 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPFP49454 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPFP49454 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPFP49454 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPFP49454 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPFP49454 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPFP49454 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPFP49454 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPFP49454 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPFP49454 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPFP49454 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPFP49454 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPFP49454 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPFP49454 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPFP49454 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPFP49454 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPFP49454 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPFP49454 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPFP49454 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPFP49454 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPFP49454 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPFP49454 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPFP49454 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPFP49454 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPFP49454 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPFP49454 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPFP49454 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPFP49454 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPFP49454 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPFP49454 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPFP49454 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPFP49454 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPFP49454 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPFP49454 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPFP49454 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms