Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEDD4P46934 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms