Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN1P35523 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN1P35523 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN1P35523 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms