Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD40LGP29965 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms