Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRAP18433 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRAP18433 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms