Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF4P18085 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF4P18085 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF4P18085 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF4P18085 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF4P18085 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF4P18085 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARF4P18085 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARF4P18085 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF4P18085 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF4P18085 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF4P18085 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF4P18085 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF4P18085 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARF4P18085 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF4P18085 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF4P18085 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF4P18085 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF4P18085 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF4P18085 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF4P18085 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF4P18085 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF4P18085 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARF4P18085 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARF4P18085 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF4P18085 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF4P18085 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF4P18085 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF4P18085 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF4P18085 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARF4P18085 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARF4P18085 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARF4P18085 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARF4P18085 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARF4P18085 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF4P18085 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF4P18085 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF4P18085 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF4P18085 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF4P18085 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF4P18085 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF4P18085 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARF4P18085 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF4P18085 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF4P18085 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF4P18085 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF4P18085 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF4P18085 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF4P18085 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF4P18085 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARF4P18085 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARF4P18085 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF4P18085 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF4P18085 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF4P18085 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF4P18085 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF4P18085 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF4P18085 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF4P18085 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF4P18085 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARF4P18085 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms