Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EPCAMP16422 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPCAMP16422 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EPCAMP16422 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms