Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL5P13501 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL5P13501 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL5P13501 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL5P13501 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL5P13501 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL5P13501 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL5P13501 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL5P13501 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL5P13501 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL5P13501 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL5P13501 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL5P13501 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL5P13501 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL5P13501 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL5P13501 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL5P13501 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL5P13501 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL5P13501 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL5P13501 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL5P13501 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL5P13501 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL5P13501 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL5P13501 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL5P13501 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL5P13501 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL5P13501 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL5P13501 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL5P13501 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL5P13501 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL5P13501 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL5P13501 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL5P13501 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL5P13501 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL5P13501 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL5P13501 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL5P13501 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL5P13501 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL5P13501 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL5P13501 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms