Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRFP10586 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRFP10586 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRFP10586 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms