Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSLP07711 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSLP07711 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSLP07711 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSLP07711 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSLP07711 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSLP07711 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSLP07711 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSLP07711 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSLP07711 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSLP07711 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSLP07711 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSLP07711 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSLP07711 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSLP07711 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSLP07711 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSLP07711 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSLP07711 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSLP07711 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSLP07711 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSLP07711 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSLP07711 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSLP07711 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSLP07711 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSLP07711 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSLP07711 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSLP07711 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSLP07711 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSLP07711 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSLP07711 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSLP07711 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSLP07711 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSLP07711 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSLP07711 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSLP07711 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSLP07711 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSLP07711 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSLP07711 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSLP07711 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSLP07711 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSLP07711 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSLP07711 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSLP07711 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSLP07711 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSLP07711 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSLP07711 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSLP07711 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSLP07711 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSLP07711 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSLP07711 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSLP07711 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSLP07711 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSLP07711 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSLP07711 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSLP07711 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSLP07711 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSLP07711 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSLP07711 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSLP07711 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSLP07711 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSLP07711 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms