Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	tN(GUU)C	tN(GUU)C	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	tN(GUU)F	tN(GUU)F	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	tN(GUU)G	tN(GUU)G	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	tN(GUU)K	tN(GUU)K	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	tN(GUU)L	tN(GUU)L	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	tN(GUU)N1	tN(GUU)N1	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	tN(GUU)N2	tN(GUU)N2	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	tN(GUU)O1	tN(GUU)O1	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	tN(GUU)O2	tN(GUU)O2	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	tN(GUU)P	tN(GUU)P	74 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	SCW4	YGR279C	1161 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	LEM3	YNL323W	1245 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	GPM3	YOL056W	912 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YHR045W	YHR045W	1683 nt		4.06	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	QRI1	YDL103C	1434 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YCR097W-A	YCR097W-A	267 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YDL124W	YDL124W	939 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	LST8	YNL006W	912 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	MRPL22	YNL177C	930 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	RPS19B	YNL302C	435 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YNR075C-A	YNR075C-A	93 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	snR10	snR10	245 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YPL113C	YPL113C	1191 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	ARR3	YPR201W	1215 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	GDE1	YPL110C	3672 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	STE7	YDL159W	1548 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	ULA1	YPL003W	1389 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	QDR1	YIL120W	1692 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	THI20	YOL055C	1656 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YGR022C	YGR022C	330 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YGR122W	YGR122W	1209 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	CBP4	YGR174C	513 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	snR19	snR19	568 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	KIP2	YPL155C	2121 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	ADE3	YGR204W	2841 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	ELP3	YPL086C	1674 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	TFC7	YOR110W	1308 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	CAD1	YDR423C	1230 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	MRPL36	YBR122C	534 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	RFT1	YBL020W	1725 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VAR1	P02381	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	GIR2	YDR152W	798 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	TFB3	YDR460W	966 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	CAB4	YGR277C	918 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	TFS1	YLR178C	660 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	ROX3	YBL093C	663 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	MGS1	YNL218W	1764 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	YDL119C	YDL119C	924 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	COS9	YKL219W	1224 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	YOL097W-A	YOL097W-A	186 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	SCO1	YBR037C	888 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	STE50	YCL032W	1041 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	NOT3	YIL038C	2511 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	AAD4	YDL243C	990 nt		4	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		4	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	IMP2	YMR035W	534 nt		4	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	RPA49	YNL248C	1248 nt		4	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	MRP21	YBL090W	534 nt		4	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	CBC2	YPL178W	627 nt		4	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	SNF2	YOR290C	5112 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	AUA1	YFL010W-A	285 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	MRP17	YKL003C	396 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	DAL82	YNL314W	768 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	YOR024W	YOR024W	324 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	OST3	YOR085W	1053 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	YBR056C-B	YBR056C-B	159 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	OPY2	YPR075C	1083 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	SSB1	YDL229W	1842 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	SSB2	YNL209W	1842 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	PEX29	YDR479C	1665 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	SSA2	YLL024C	1920 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	STR2	YJR130C	1920 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	YGR269W	YGR269W	327 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	NAT5	YOR253W	531 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	MNN1	YER001W	2289 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	NUP1	YOR098C	3231 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	TOS4	YLR183C	1470 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	YJL206C	YJL206C	2277 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	SED4	YCR067C	3198 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	HST4	YDR191W	1113 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	SUA5	YGL169W	1281 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	EGD2	YHR193C	525 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	YJL107C	YJL107C	1164 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	DCN1	YLR128W	810 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	CSL4	YNL232W	879 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	RTT106	YNL206C	1368 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	PRO2	YOR323C	1371 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	PAN1	YIR006C	4443 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	ORC6	YHR118C	1308 nt		3.96	□□□□□ -1.77
VAR1	P02381	CDC15	YAR019C	2925 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	AXL2	YIL140W	2472 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	MAK32	YCR019W	1092 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	CNL1	YDR357C	369 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	RPL28	YGL103W	450 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	XPT1	YJR133W	630 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	PGU1	YJR153W	1086 nt		3.96	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 107.9 ms