Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
RAPGEF3O95398 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RAPGEF3O95398 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RAPGEF3O95398 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms