Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK1O75385 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK1O75385 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK1O75385 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK1O75385 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK1O75385 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK1O75385 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK1O75385 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ULK1O75385 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK1O75385 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK1O75385 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK1O75385 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK1O75385 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK1O75385 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK1O75385 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK1O75385 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK1O75385 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK1O75385 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK1O75385 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK1O75385 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK1O75385 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK1O75385 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK1O75385 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK1O75385 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ULK1O75385 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ULK1O75385 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ULK1O75385 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ULK1O75385 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ULK1O75385 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ULK1O75385 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms