Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR5O60602 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR5O60602 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR5O60602 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR5O60602 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR5O60602 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR5O60602 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR5O60602 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR5O60602 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR5O60602 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR5O60602 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR5O60602 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR5O60602 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR5O60602 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR5O60602 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR5O60602 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR5O60602 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR5O60602 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR5O60602 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR5O60602 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR5O60602 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR5O60602 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR5O60602 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR5O60602 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR5O60602 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR5O60602 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR5O60602 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR5O60602 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR5O60602 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR5O60602 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR5O60602 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR5O60602 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR5O60602 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR5O60602 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR5O60602 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR5O60602 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR5O60602 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR5O60602 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR5O60602 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR5O60602 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR5O60602 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR5O60602 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR5O60602 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR5O60602 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR5O60602 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR5O60602 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR5O60602 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR5O60602 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR5O60602 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR5O60602 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR5O60602 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR5O60602 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR5O60602 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR5O60602 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR5O60602 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR5O60602 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR5O60602 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR5O60602 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR5O60602 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR5O60602 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR5O60602 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms