Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KCNQ3O43525 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNQ3O43525 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCNQ3O43525 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNQ3O43525 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNQ3O43525 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNQ3O43525 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNQ3O43525 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCNQ3O43525 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCNQ3O43525 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCNQ3O43525 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms