Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KPNA3O00505 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms