Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCP1A6NGW2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCP1A6NGW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
STRCP1A6NGW2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
STRCP1A6NGW2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms