Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YY10 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0J9YY10 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms