Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0J9YXV3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms