Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH3

AU041133, Expressed sequence AU041133, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU041133A0A0J9YVH3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AU041133A0A0J9YVH3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AU041133A0A0J9YVH3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AU041133A0A0J9YVH3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms