Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP20Q9Y2K6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms