Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms