Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms