Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTCH4Q99466 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms