Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBRM1Q86U86 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms