Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CNTN1Q12860 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CNTN1Q12860 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CNTN1Q12860 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN1Q12860 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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