Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms