Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RECQLP46063 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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