Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms