Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms