Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms