Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms