Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL6Q6ICC9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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