Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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